func ExampleSeq_Stitch() {
f := fs{
&fe{s: -1, e: 4},
&fe{s: 30, e: 38},
}
fmt.Printf("%-s\n\n%-s\n", n, n.Consensus(false))
if err := sequtils.Stitch(n, n, f); err == nil {
fmt.Printf("\n%-s\n\n%-s\n", n, n.Consensus(false))
} else {
fmt.Println(err)
}
// Output:
// ACGCTGACTTGGTGCACGTACGTGCACCAAGTCAGCGT
// ACGGTGACCTGGCGCGCATATGCGCGCCAGGTCACCGT
// ACGtTGACGTGGCGCTCATATGAGCGCCACGTCATCGT
// acgCtg--------------------------caGcgt
//
// acgctgacntggcgcncatatgngcgccangtcagcgt
//
// ACGCGTCAGCGT
// ACGGGTCACCGT
// ACGtGTCATCGT
// acgC--caGcgt
//
// acgcgtcagcgt
}
func ExampleSeq_Stitch() {
s := NewSeq("example DNA", []alphabet.Letter("aAGTATAAgtcagtgcagtgtctggcagTGCTCGTGCgtagtgaagtagGGTTAGTTTa"), alphabet.DNA)
f := fs{
fe{s: 1, e: 8},
fe{s: 28, e: 37},
fe{s: 49, e: s.Len() - 1},
}
fmt.Printf("%-s\n", s)
if err := sequtils.Stitch(s, s, f); err == nil {
fmt.Printf("%-s\n", s)
}
// Output:
// aAGTATAAgtcagtgcagtgtctggcagTGCTCGTGCgtagtgaagtagGGTTAGTTTa
// AGTATAATGCTCGTGCGGTTAGTTT
}
